Proteomika > VÚ SAV > Prístroje

Centrum

Proteomika

Lokalizácia

Virologický ústav SAV

Názov prístroja/Softwaru

Q-Tof Premier™ hmotnostný spektrometer s nanoACQUITY UPLC™   (Waters)

Charakteristika prístroja /softwaru

nanoACQUITY UPLC™ je unikátny prístroj, ktorý ponúka nové možnosti použitia kvapalinovej chromatografie v oblasti tzv. Ultra Performance Liquid Chromatography (do 5.000psi). Využíva k separácii látok sorbenty s malými časticami (menšie ako 2um), čoho prínosom je predovšetkým  mnohonásobná účinnosť deliaceho procesu, kratšia doba analýzy a vyššia citlivosť.

Q-Tof Premier™ je nový hybridný MS systém kvadrupól-TOF vybavený modernou T-wave™ technologiou (travelling wave), s vysoko efektivnym a rýchlym prenosom ionov od ionového zdroja až k ích detekcii. Systém je vhodný  na  LC-MS/MS identifikáciu látok na základe stanovenia  presnej hmoty.

Technická špecifikácia

Charakteristika:

• Nízke prietokové rýchlosti do 5 μl/min (bežne okolo 200nl/min)
• Možnosť použitia kapilárnych a nanokapilárnych kolón
• Kontinuálne prepínanie referenčného spreja - nano-LockSpray/LockSpray
• Vysoká presnosť stanovenia hmoty, rutinne < 3 ppm
• Ortogonálne akcelerovaný analyzátor doby letu (TOF)
• T-wave™ technológia (T-wave™ ionový tunel / T-wave™ kolízna cela)
• Dvojitý ortogonálny Z-spray
• ESI/ nanoESI ionizácia za atmosférického tlaku
• Rozsah hmôt m/z do 100.000 amu (V-mode)
• Rozsah účinnosti kvadrupólu  8.000 amu
• Rozlišenie až 17.500 FWHM (W-mode)
• Skenovacia rýchlost až 20 spektier/sec s použitím 4 GHz TCD prevodníka
• Stanovenie presnej hmoty v širokom koncentračnom rozmedzí
• Programovateľné rozšírenie lineárného dynamického rozsahu (pDRE)
• Zvýšená citlivosť (Enhanced Duty Cycle) pri režime Precursor Ion Dicrovery™
• Automatické prepínanie MS a MS/MS režimu (DDA™- Data Directed Analysis)

Komponenty

• nano ESI  a ESI ionizačný zdroj
  
• Počítač s dátaspracujúcim programom MassLynx™kontrolujúcim získavanie dát
• Počítač s vyhodnocovacím programom ProteinLynx Global Server™

Kolóny

• C18 reverzná fáza
  
  

Kontaktná osoba

Ing. Rudolf Toman, DrSc., Ing. Ľudovít Škultéty, PhD.

Doplňujúce informácie

www.waters.com

Centrum

Proteomika

Lokalizácia

Virologický ústav SAV

Názov prístroja/Softwaru

Multiphor II elektroforetická jednotka so zdrojom stabilizovaného prúdu EPS 3501 XL, UMAX skenerom a vyhodnocovacím programom Image Master Platinum (Amersham Biosciences)

Charakteristika prístroja /softwaru

Multiphor™ II je univerzálna, veľmi flexibilná, elektroforetická jednotka, ktorá umožňuje uskutočniť prvý – izoelektrickú fokusáciu (IEF), ako aj druhý rozmer – SDS PAGE na tom istom zariadeni. IEF sa  pritom prevádza na komerčných, rôzne dlhých, 3mm širokých  gélových pásikoch  s imobilizovaným pH gradientom (IPG), za ktorou pri dvojrozmernej (2D) elektroforéze nasleduje horizontálna SDS PAGE. Je vhodná najmä pre ultratenké komerčné gély (0.1-0.5 mm) ukotvené na plastovej alebo sklennej podložke o rozmeroch do 20 × 26 cm.

UMAX skener má extrémne širokú škálu optických hustôt, ktorá zabezpečuje veľmi vysoké rozlíšenie, potrebné pre  kvantitatívnu analýzu Coomasie alebo striebrom farbených gélov. 

ImageMaster™ 2D Platinum  je program, v ktorom je spojená vynikajúca detekcia škvŕn 2D gélu s ich spoľahlivým párovaním. Jeho základom je širokovyužívaný program Melanie na obrazovú analýzu 2D gélov.

Technická špecifikácia

Charakteristika:

Multiphor™ II

• Systém je možné použiť na 1-D alebo 2-D elektroforézu proteínov, alebo  DNA fragmentačnú analýzu.
• Pracuje až s 12 IPG pásikmi (7-24 cm) súčasne.
• Možnosť použiť širokú škálu komerčných, ako aj pripravených gélov pre unikátne aplikácie.
• Umožňuje účinné a rovnomerné chladenie ultra tenkých gélov pomocou keramickej chladiacej platne s cieľom zlepšiť rozlíšenie a skrátiť čas separácie použitím vyššieho napätia.
• Nastaviteľné elektródy umožňujú použitie rôzne veľkých gélov.
  
  

UMAX skener

• Je schopný pracovať s ČB alebo farebnými odrazovými predlohami a to negativnymi, pozitívnymi, alebo priesvitnými.
• Optické rozlíšenie 1200 x 2400 dpi
• Plocha snímania 305 x 457 mm (odraz), 241 x 305 mm (priesvitka)
• CCD prvok: trojlineárny s 10 600 bodmi
• Zdroj svetla: žiarivka so studenou katódou
• Optická hustota: 3.7 Dmax
• Farebná hĺbka: 24/42 bitov
• Podporovaný OS:MS Windows 98SE/2000/XP a MacOS 9.x a vyšší

ImageMaster™ 2D Platinum  I

• Rozhranie pre správu a analýzu rôznych obrazových formátov.
• Vynikajúcia detekcia škvŕn a filtrovanie minimalizujúce vplyv pozadia gélu.
• Možnosť automatického alebo manuálneho párovania.
• Detekcia proteínových márkerov pomocou spoľahlivej analýzy kvantitatívnych variacii proteínových škvŕn v jednom, či v rôznych géloch.
• Obrovské možnosti zobrazenia a prekryvania umožňujú interaktívne pracovať s obrázkami, tabuľkami  a grafmi.
• Užívateľské rozhranie umožňuje jednoduché  a logické ovládanie nástrojov, čím sa stáva systém analyzy flexibilný a komplexný

Komponenty

• Rehydratačná komôrka na 18 cm IPG
  
  

Kontaktná osoba

Ing. Rudolf Toman, DrSc., Ing. Ľudovít Škultéty, PhD.

Doplňujúce informácie

http://www4.amershambiosciences.com