Proteomika > PRIF UK > Služby

Centrum

Proteomika

Lokalizácia

Prírodovedecká fakulta UK

Názov analýzy/služby

Dvojrozmerná elektroforéza

Popis analýzy/služby

• Svojpomocne uskutočnená izoelektrická fokusácia (IEF) na gélových pásikoch s imobilizovaným pH gradientom (IPG).
• Svojpomocne uskutočnená horizontálna elektroforéza v prostredí SDS, alebo v natívnej forme.
• Svojpomocne uskutočnený elektroblot na membránu.
• Svojpomocne uskutočnené skenovanie a analýza vizualizovaného gélu pomocou programu Image Master Platinum

Technické požiadavky na vzorky

Pred identifikáciou individuálneho proteínu v komplexnej zmesi viacerých proteínov tvoriacich bunkový (subcelulárný, organelový, tkanivový...) proteóm je potrebné proteíny (prípadne ich časti) separovať. Bežná, doteraz používaná technológia s veľmi vysokým rozlíšením, na ktorú spoliehajú proteómové analýzy, je dvojrozmerná polyakrylamidová elektroforéza. Procedúra, postupujúca v dvoch krokoch, väčšinou separuje proteíny na základe ich rozdielov najskôr v elektrickom náboji (izoelektrická fokusácia) a následne v molekulovej hmotnosti.

Je nutné si uvedomiť:
2D elektroforéza je vhodná na separáciu aj tisícov až desaťtisícov proteínov.
Zhruba 5% proteínov a 30% peptidov migruje anormálne.
Posttranslačné modifikácie  ovplyvňujú náboj a hmotnosť proteínu (chyba až 50%)
Problematický transport proteínov z gélovej matrice (elektroblot na membránu)

Vzorka na 2D elektroforézu ma obsahovať cca 120-400ug proteínov.

Spôsob dodania vzorky

Osobne po telefonickej dohode so zodpovedným pracovníkom

Spôsob odovzdania výsledkov

Osobne

Použitá prístrojová technika

Multiphor II elektroforetická jednotka so zdrojom stabilizovaného prúdu EPS 3501 XL, UMAX skener, vyhodnocovací program Image Master Platinum (Amersham Biosciences)

Doba vybavenia objednávky

Podľa dohody

Cena analýzy/služby pre člena BITCETu

100 Sk* / IEF, 50 Sk* / SDS PAGE, 200 Sk* / skenovanie a vyhodnotenie 2D vizualizovaného gélu pomocou programu Image Master Platinum (*Virologický ústav SAV a BITCET poskytuje len pracovný priestor,  prístrojové vybavenie a konzultačnú službu). Spotrebný tovar si hradí objednávateľ z vlastných zdrojov.

Cena analýzy/služby pre nečlena BITCETu

200 Sk* / IEF, 100 Sk* / SDS PAGE, 400 Sk* / skenovanie a vyhodnotenie 2D vizualizovaného gélu pomocou programu Image Master Platinum (*Virologický ústav SAV a BITCET poskytuje len pracovný priestor,  prístrojové vybavenie a konzultačnú službu). Spotrebný tovar si hradí objednávateľ z vlastných zdrojov.

Kontaktná osoba

Prof. RNDr. Dušan Kanianský, DrSc., Doc. RNDr. Jozef Marák, CSc.

Doplňujúce informácie

V prípade fyzického poškodenia zariadenia, alebo jeho častí, budú účtované oprávnené náklady na ich opravu/ výmenu.

Objednávkový formulár

Nie