Proteomika > NEiÚ SAV > Prístroje

Centrum

Proteomika

Lokalizácia

Neuroimunologický ústav SAV

Názov prístroja/Softwaru

Prístroj pre analýzu interakcií biomolekúl pomocou povrchovej plazmónovej rezonancie typ BIACORE3000

Charakteristika prístroja /softwaru

BIACORE3000 je jeden z najlepších prístrojov určených pre štúdium interakcií biomolekúl, bez potreby ich značenia. Spektrum materiálov a látok, ktoré sa dajú prístrojom charakterizovať zahŕňa malé organické molekuly, biomakromolekuly aj hrubé extrakty tkanív; lipidické vezikuly, vírusy, baktérie aj eukaryotické bunky.

Hlavné aplikačné použitie: imunologické štúdie, tiež pre preklinické a klinické skúšky; characterizácia väzbovosti a stability proteínov a nuklevých kyselín; väzbové štúdie ligandov. Systém BIACORE3000 obsahuje príslušenstvo umožňujúce automatickú izoláciu naviazaných frakcií a ich prenos na MALDI nosič pre následnú chrakterizáciou hmotnostnou spektrometriou, čím sa zaraďuje aj medzi kľúčové prístroje vo funkčnej genomike a proteomike.

Presné automatizované meranie kinetických parametrov väzby pri rôznych teplotách umožňuje plnú kinetickú a termodynamickú charakterizáciu interakčných systémov.

Technická špecifikácia

• automatické pipetovanie a nástrek vzorky
• maximálny počet vzoriek v automatickom dávkovači: 96-jamková platnička (max. objem vzorky 250-300 (l) alebo drziak na cca 40 vzoriek (max. objem 700-800 (l), alebo drziak na 24 mikrocentrifugačných skúmaviek (max. objem 1,5-2,0 ml).
• detekčný limit pre malé molekuly 180 Da
• analytická citlivosť pre makromolekuly: 1 pM myoglobinu MW 17000 Da (závisí nepriamo úmerne od molekulovej hmotnosti)
• rozsah bežne používaných koncentrácií biologických makromolekúl 10 (M – 1 nM
• orientačná spotreba vzorky na jeden nástrek 5-500 (l v závislosti od aplikácie
• doba trvania jednoho merania 15-40 min
• výsledky merania: disociačná rovnovážna konštanta KD, asociačná a disociačná rýchlostná konštanta kON a kOFF.
• minimálny objem vzorky závisí od použitej aplikácie, hluchý objem pri nástreku je 20-80 (l v závislosti od typu nástreku
• rozsah prietokových rýchlostí: 1-100 (l/min
• rozsah merateľných indexov lomu: 1.33-1.40
• rozsah nastavenia teploty v meracej cele: 4-40( C
• 4 analytické prietokové cely (1, 2, 3, 4), možnosť použitia jednotlivo, v sérii alebo ako dve dvojice
• možnosť automatického odčítania signálu v referenčnej cele (kombinácie 2-1, 3-1, 4-1, 4-3)

Komponenty

• Prístroj BIACORE3000 s integrovanou mikrofluidickou jednotkou a automatickým dávkovačom vzoriek
• PC kontrolujúci získavanie dát a ich vyhodnocovanie
• Windows 2000 Professional, Biacore Control Software version 4.1, BIAevaluation Software version 4.1
• Externý chladiaci obehový termostat pre chladenie vzoriek v držiakoch automatického dávkovača vzoriek
  

Príslušenstvo

• automatický spoter eluovaných vzoriek na MALDI nosiče
• externý kit na prípravu senzorčipov
  

Senzorčipy:

• spolu 8 druhov, typy aktívnych povrchov pozri materiály vyrobcu

Kontaktná osoba

RNDr. Rostislav Škrabana PhD

Doplňujúce informácie